قالیباف در سال ۱۳۷۹ با حکم مقام معظم رهبری، فرماندهی نیروی انتظامی ایران را عهدهدار شد. قالیباف دربارهٔ حوادث تیرماه ۱۳۷۸ میگوید آن روزها «اوج کمرنگی روابط پلیس و مردم، پلیس و دانشگاه بود.»
از جمله اقدامهای وی میتوان تجهیز نیرو به خودروهای روز دنیا مانند مرسدس بنز و تویوتا برای نیروهای عملیاتی نام برد. از دیگر اقدامات وی راهاندازی پلیس ۱۱۰، ایجاد دفاتر خدمات الکترونیک پلیس+۱۰، سامانه نظارتی ۱۹۷، و دانشکدههای جدید پلیس است.